En febrero de 1997, fue destituido el ex presidente Abdalá Bucaram, tras ser declarado incapaz mental para gobernar, por 42 de los 80 diputados. La resolución la tomó el Congreso Nacional, que nombró como presidente interino a Fabián Alarcón Rivera. No permitió la sucesión a la vicepresidenta Rosalía Arteaga.

Bucaram fue acusado de mal uso de gastos reservados y de otros hechos de corrupción. Desde 1997 permaneció asilado en Panamá y regresó recientemente después de que la Corte declaró la nulidad de los juicios que se desarrollan en su contra.

En febrero y marzo de 1997, también fueron descalificados varios diputados por haber participado en hechos de corrupción.
El presidente Interino convocó más tarde a una consulta popular para legalizar su situación.

En 1998 se convocó a una asamblea constituyente para reformar la Constitución. En esas reformas se introdujeron algunas disposiciones para evitar los hechos que ocurrieron en 1997. La nueva constitución fue puesta en vigencia el 10 de agosto de 1998, cuando tomó posesión del cargo Jamil Mahuad.

En el período de Mahuad estalló la crisis bancaria y se agravó la devaluación del sucre. Este régimen afrontó dos bloqueos por los taxistas del país y movilizaciones de los indígenas.

El 21 de enero del 2000, fue destituido del cargo tras un levantamiento indígena, cívico-militar, que se tomó el Congreso, la Corte Suprema de Justicia y el Palacio de Carondelet. El Congreso lo cesó en sus funciones por abandono del cargo.

El levantamiento del 21 de enero fue encabezado por el coronel Lucio Gutiérrez. Después fundó el partido Sociedad Patriótica, con el que llegó al poder.
Por unas horas, el poder estuvo en manos de un triunviro: general Carlos Mendoza, Carlos Solórzano Constantine y Antonio Vargas.

Tras la caída del presidente Mahuad, asumió el poder Gustavo Noboa, quien era el vicepresidente. Noboa ejerció el poder hasta el 15 de enero del 2003, en que asumió Gutiérrez.

Posteriormente, Noboa fue enjuiciado por el diputado socialcristiano León Febres Cordero, por lo que salió con asilo a República Dominicana.

Los presidentes en diez años

- Sixto Durán Ballén, terminó su período en 1996.
- Abdalá Bucaram Ortiz, de agosto de 1996 a febrero de 1997.
- Rosalía Arteaga, por dos días.
- Fabián Alarcón Rivera, 18 meses.
- Jamil Mahuad: 10 de agosto del 98 a enero de 2000.
- Triunviro: Carlos Mendoza, Carlos Solórzano Constantine y Antonio Vargas. Tomó el poder por varias horas.
- Gustavo Noboa Bejarano, de enero del 2000 a enero del 2003.
- Lucio Gutiérrez, enero de 2003 al 20 de abril de 2005.